随着人类文明的发展，农业在社会发展中的地位在不断提升，但不可否认的是，我国农业还存在很大的问题。“十三五”我国现代农业将进入加速发展阶段，这些问题都将滞缓我国现代农业发展进程。
(一)农产品供需的结构性矛盾突出，需调整优化农业生产结构
我国居民人均大米、小麦等谷物消费从九十年代后期就开始呈下降趋势，而畜产品、水产品和蔬菜水果等高附加值农产品占食物消费的比例持续快速增长。但是，我国农业生产结构调整滞后于优质化、多样化和专用化的需求结构变化，牛羊肉、奶类、优质高端苹果等高品质产品供需矛盾加剧。“十三五”期间农业结构调整优化的思路是：重点保口粮，统筹兼顾棉油糖、蔬菜等其他农产品生产，充分挖掘饲草料生产潜力，大力发展草牧业，促进粮食主产区的农牧结合、粮经饲兼顾，努力提升大中城市的“菜篮子”产品自给能力。
(二)国内农业支持政策困境初显，应充分发挥收入补贴、保险补贴等“绿箱”政策作用
宋洪远课题组认为，新时期国内农业政策面临很大困境：一是支持和保护政策导致农产品接近价格“天花板”;二是WTO“黄箱政策”限制使国内农业生产补贴增加的空间受限。“十三五”期间，政府应全面减少对口粮之外的农产品的政策干预，总结我国棉花和大豆差价补贴政策试点的经验，适时推出对糖类、油料、玉米等产品的差价补贴政策。扩大“绿箱”支持，适度增加对农民收入的转移支付支持力度，将部分属于“黄箱政策”的农业补贴转变为“按历史面积补贴”的绿箱补贴;提高农业保险的补贴力度，增加农业保险覆盖的品种范围，逐步探索建立巨灾风险保障机制;增加对环境保护的支持力度，提高农业可持续发展能力。
(三)科技创新能力仍是现代农业发展的瓶颈，需进一步强化科技支撑能力建设
中国人民大学仇焕广课题组认为推进现代农业发展、推进“四化同步”，必须进一步强化科技创新，依靠创新驱动实现农业增产增效。“十三五”期间，应紧紧围绕条件建设、技术创新、集成示范、成果转化四大环节，瞄准关键技术突破、创新机制完善、创新人才培养、成果转化率提高四大目标，不断加大投入力度，夯实现代农业发展的科技基础。
(四)农业发展面临巨大人才缺口，应加大农村人才培养力度
北京理工大学刘平青课题组认为，“十三五”期间，人才将成为制约我国农业发展的关键性因素。一是我国农业产业在世界竞争格局中仍处在产业链的中低端，农业科技人才数量不足，质量有待提高;二是农村大量青壮年劳动力外出务工，农村“空心化”，农村实用型人才“青黄不接”;三是农村基层干部队伍年龄结构老化问题严重。决策部门设计“十三五”农业产业发展及农业项目支持方案时，要将人才培养作为重要内容，促使项目推进与人才培养齐头并进。
(五)农业生产的环境负效应日益凸出，要加大对农业资源环境保护和生态建设的支持
农业部农村经济研究中心金书秦课题组认为，我国为了保障国内较高水平的“粮食自给率”，忽视了水土资源利用和环境的可持续性。“十三五”期间，应在促进农业生产的同时，更加注重保护生态环境：一是要推进农业秸秆的综合利用;二是要强化对化肥农药使用的管理，推广实施精准施肥等技术;三是要加强对规模化畜禽养殖粪污排放的管理。通过农业投入品减量和农业废弃物资源化利用相结合的途径促进农业绿色发展。
(六)“十三五”农民增收面临严峻挑战，需加快建立农民持续增收的长效机制
农业部农村经济研究中心张红奎课题组认为，宏观经济步入“新常态”，一是导致农产品需求和出口下降，农业生产需要的劳动力数量减少，加上非农劳动力需求下降，可能导致农村劳动力的失业率上升，农民收入下降;二是政府的财政收入增幅放缓，对农业和农村发展的支持力度下降，对农村社会事业发展和反贫困产生不利影响。“十三五”期间，应加快建立农民持续增收的长效机制。提高农村转移劳动力的劳动生产率，持续较快增加农民工资性收入;创新农业经营体系，持续较快增加农民经营性收入;推进农村产权制度改革，持续较快增加农民财产性收入;加强农村社会保障，持续较快增加农民转移性收入;加大扶贫和救助力度，持续较快增加农村贫困人口收入。
一项生猪养殖专项补贴，令一个农业大市8个县(区、市)的畜牧局在任或原任局长被立案侦查。
广东省梅州市检察机关今年查办“生猪标准化规模养殖场(小区)改扩建项目中央专项补贴”职务犯罪，截至7月初已立案侦查31件31人，涉及专项补贴资金超过7000万元。
连一头猪都没有就骗补50万元
日前，“新华视点”记者在梅州市蕉岭县三圳镇福北村村道旁见到，一间大约数百平米的石棉瓦房大门紧锁。越过近2米高的围墙往里看，既没有一头生猪，也闻不到一丝养猪场常有的味道。然而，在申报生猪补贴的材料中，这处院子名为“福生养猪场”，规模为“每年出栏超过2000头猪”，获得了50万元的国家补贴资金。
“今年3月，我们拿着补贴登记的名单在村里找这个养猪场，可怎么也找不到。”蕉岭县人民检察院一位办案人员说，他们在附近询问了许多村民，没有任何一个村民听说村里有一个所谓的“福生养猪场”。
这条线索引起检察机关对生猪补贴可能存在弄虚作假问题的关注，继而掀起了一场打击生猪补贴职务犯罪的反腐风暴。
据梅州市人民检察院副检察长李永平介绍，截至7月初，梅州查办生猪标准化规模养殖场(小区)改扩建专项补贴系列案31件31人，初步统计涉及专项补贴资金7000多万元，造成国家经济损失1000多万元。他说：“这是梅州检察机关历年来查办案件中办案规模最大、查处范围覆盖最广、查处人数最多的系列案。”
值得关注的是，梅州全市下属的梅江、梅县、兴宁、平远、蕉岭、大埔、丰顺、五华等8个县(市、区)，都有在任或原任畜牧局长被立案查处。其他犯罪嫌疑人还包括县级畜牧局副局长9人、农业局长2人、农业局副局长1人、发改局副局长1人、畜牧股长5人。
李永平说，立案查办的涉案人员多是县级畜牧、农业、发改等项目补贴主管部门领导，具有较集中的项目分配权和审批权，其中多数涉嫌滥用职权和玩忽职守，少数涉嫌受贿和贪污。其滥用职权、玩忽职守的涉案金额从30万元到150万元不等，贪污、受贿罪涉案金额(含非法所得)从5万元到60万元不等。
