为贯彻党中央、国务院关于加强生态文明建设、推动绿色发展的决策部署，切实加强农业资源与生态环境保护，依据《全国农业现代化规划（2016—2020年）》《全国农业可持续发展规划（2015—2030年）》《农业环境突出问题治理总体规划（2014—2018年）》《全国生态保护与建设规划（2013—2020年）》等规划，编制本规划。
一、发展现状
（一）主要成效
“十二五”以来，党中央、国务院高度重视农业资源保护和生态环境建设，不断加大投入力度，实施了高标准农田建设、旱作节水农业、退牧还草、京津风沙源治理等一系列重大工程，取得积极进展。一是耕地保护基础不断夯实。建成东北黑土地高标准农田面积近4000万亩，西北旱作节水农业示范区约700万亩，湖南重金属污染耕地修复与种植结构调整试点区170万亩，区域农业基础条件和耕地质量得到有效改善。二是草原保护与建设成效显著。2015年，草原综合植被盖度为54%，比2011年提高3个百分点；重点区域天然草原平均牲畜超载率15.2%，比2011年下降12.8个百分点；累计落实草原承包面积42.5亿亩，占草原总面积的72%。草原生态持续恶化的势头得到了初步遏制，局部草原生态状况改善明显。三是水生生物资源养护与生态修复稳步推进。水生生物增殖放流全面开展，海洋牧场建设不断推进，海藻场和海草床建设初见成效，水生生物保护区体系基本建立。四是外来生物入侵防控体系初步构建。建设外来入侵生物防治示范区20个、天敌繁育基地24个、生物替代技术示范基地3个，形成了一批有效防治典型外来入侵生物的办法，推广示范一批综合防控技术。五是农业面源污染防治取得积极进展。建成全国农业面源污染国控监测网络，建设了106个国家级农作物病虫害绿色防控技术集成示范区，新创建了一批国家级畜禽养殖标准化示范场、规模化大型沼气工程和规模化生物天然气工程，在太湖、洱海、巢湖和三峡库区建设了一批流域农业面源污染综合治理示范区。
（二）面临问题
“十三五”时期，农业资源与生态环境保护工作仍面临诸多困难和问题。一是部分区域耕地质量退化问题依然突出。东北黑土区耕地有机质含量下降，理化性状变差，农田生态功能退化；南方部分地区耕地重金属超标，治理难度大；西北旱作农区农田水利基础设施建设欠账多，农田灌溉水有效利用系数还不高。二是草原生态环境依然脆弱。全国草原生态总体恶化局面尚未根本扭转，中度和重度退化草原面积仍占1/3以上。部分地区乱开乱垦、乱采滥挖等破坏草原现象屡有发生。草原旱灾、鼠虫害和毒害草灾害频发，已恢复的草原生态仍很脆弱。三是外来入侵生物蔓延的态势依然存在。入侵我国的外来生物呈现传入数量增多、传入频率加快、蔓延范围扩大、发生危害加剧的严峻态势。据不完全统计，目前入侵我国的外来物种高达529种，每年造成的经济损失超过千亿元，已成为生物多样性利用与保护、经济社会可持续发展的重大威胁。四是渔业物种资源保护形势依然严峻。受拦河筑坝、围湖造田、交通航运和海洋海岸工程等社会经济活动影响，重要水生生物产卵场、索饵场、越冬场和洄游通道被不同程度污染和破坏，鱼类栖息地持续丧失，天然渔业资源量锐减，水生生物资源严重衰退。五是农业面源污染依然突出。化肥农药兽药等投入品不合理使用、畜禽粪污随意处置、秸秆田间焚烧等现象仍然存在，农膜回收利用率依然不高。六是农业湿地侵占破坏问题依然严重。重要水域农业湿地被破坏、被开发问题仍然存在，水生生物多样性受到破坏，生态系统质量及稳定性下降。
（三）发展机遇
“十三五”期间，农业资源与生态环境保护仍面临前所未有的机遇。党的十八大提出的“五位一体”总体布局，党的十八届五中全会将绿色发展作为五大发展理念之一，为加强农业资源与生态环境保护工作指明了方向。我国经济总量已稳居世界第二位，综合国力大幅提升，基础设施建设水平全面跃升，为农业资源与生态环境保护提供了基础保障。农业供给侧结构性改革深入推进，全国农业可持续发展等规划顺利实施，农业发展方式加快转变，农业科技创新不断推进，为加强农业资源与生态环境保护提供了不竭动力。主要农产品连年丰收、农产品需求增速有所放缓，为加强农业资源与生态环境保护提供了战略机遇。
总体来看，“十三五”时期是农业资源与生态环境保护的加快推进期，必须贯彻落实生态文明建设、推进绿色发展的要求，瞄准重点区域、突出问题，加大投入力度，全面加强农业资源与生态环境保护力度，推动形成资源利用节约高效、生态环境良好的农业现代化发展格局，为实现农业可持续发展奠定坚实基础。
二、总体思路
（一）指导思想
深入贯彻党的十八大和十八届三中、四中、五中、六中全会精神，坚持绿水青山就是金山银山的理念，以绿色生态为导向，以改革创新为动力，以降低利用强度、改善产地环境、发展绿色产品为目标，突出加强重要资源保护，强化重点区域环境治理，促进农业废弃物资源化利用，发展资源节约型、环境友好型、生态保育型农业，努力把过高的资源利用强度降下来，把农业面源污染加重的趋势缓下来，推动农业发展方式加快转变，走产出高效、产品安全、资源节约、环境友好的农业现代化道路，促进农业可持续发展。
（二）基本原则
——保护优先、节约优先。顺应自然规律，通过最严格的管控，把节约资源和保护环境摆在优先位置，不走“先污染后治理”的老路，以保护和节约促持续利用，降低资源利用强度，推动生态环境恢复。
——突出重点、分类施策。重点加强耕地、水、草原、渔业等重要农业资源和生态保护，加强东北黑土区、南方重金属污染区、京津冀地下水超采区、北方农牧交错带、西北干旱区、西南石漠化区等区域环境突出问题治理，加大“一控两减三基本”推进力度，分区分类采取不同措施，积极稳妥推进。
——明确权责、合力推进。加强部门间协作，强化工作指导，加大投入支持，将有关农业资金项目与绿色发展成效相挂钩，调动和激励市场主体推进绿色发展的积极性，形成推进农业资源与生态保护的合力。
——改革创新、完善机制。强化科技支撑，创新体制机制，发挥新型经营主体在绿色发展中的引领作用，建立以绿色生态为导向的农业补贴制度，强化法治保障，培育资源和环境保护新动能，建立长效机制。
（三）保护目标
通过5年努力，实现农业资源永续利用水平明显提升，农业环境突出问题治理取得积极进展，农业生态功能得到改善恢复，农业绿色化发展取得重要进展。
——资源过度开发的趋势得到初步遏制。力争耕地重度污染面积不扩大，土壤清洁率达到80%以上。基本实现农业“一控两减三基本”目标，农田灌溉水有效利用系数超过0.55，主要农作物化肥、农药利用率达到40%，农膜回收率达到80%，养殖废弃物综合利用率达到75%。
——重点区域环境问题治理取得阶段性成效。东北黑土退化区、南方重金属污染区、京津冀地下水超采区、西南石漠化区、草原生态治理区治理技术体系和推进机制基本建立，耕地轮作休耕全面推进，主要农产品产地实现农产品安全达标生产。北方农牧交错带、西北干旱区农业结构适应性水平、可持续发展水平明显提升。
——农业生态功能得到恢复和增强。基本控制草原退化沙化和渔业水域资源荒漠化趋势，草原综合植被盖度达到56%，有代表性的草原类型及珍稀濒危野生动植物资源得到有效保护，重大外来有害入侵物种得到有效遏制。
——绿色生态农业发展机制基本建立。基本构建科学的考评机制、合理化的生态补偿机制、市场化的投入交易机制、法制化的监督问效机制。
