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1、贯彻执行《中华人民共和国种子法》和《甘肃省农作物种子条例》等有关种子方面的法律、法规和方针、政策。
2、负责种子市场的监督管理工作。
3、负责农作物种子质量的监督检验、委托检验和仲裁检验。
4、编制农作物种子发展规划。组织实施农作物品种引进、区域试验、示范、繁育、推广计划、发布信息。组织农作物种子质量标准的实施。
5、负责农作物品种管理。
6、负责辖区内《农作物种子生产、经营许可证》的审核、核发。
7、管理农作物种子生产、经营和进出口及对外合作。
8、负责救灾备荒种子储备工作。
9、负责培训农作物种子专业技术人员和和管理人员。
10、依法查处种子生产、经营活动中的违法行为。
11、承办上级部门交办的其他事项。
1、办公室：协助站领导处理日常工作；负责站人事劳资、财务、技术职称、日常事务工作；负责机关会议组织、公文、综合材料和各项内部管理制度的起草、修改、政务信息、文电的收发、处理及档案管理和保密工作；负责公共设施的使用、维修、管理；负责信访、计划生育、医保、劳保、福利、离退休干部管理、后勤服务和安全保卫工作；督促各项内部管理制度的落实和实施。
2、市场监督管理科：负责贯彻执行国家及省上有关种子法律法规；负责种子生产、经营市场的管理，查处无证经营行为、制售假冒伪劣种子行为、经营未审定品种的行为、设立分支机构不登记备案的行为；负责品种维权工作，配合有关部门查处品种侵权案件；负责农民自繁自用种子在集贸市场销售串换的管理、原包装种子经营的管理，代销种子的管理，重大种子案件的查处。
3、质量监督检验科：负责农作物种子质量检验、质量纠纷田间现场鉴定；负责种子质量认证工作；负责有关标准的制定（修订）、试验验证工作及检验新技术、新方法的研究。
4、种业发展科：负责植物新品种保护条例的宣传、贯彻；起草制定并组织实施全市种业发展规划；组织落实国家、省、市主要农作物品种区域试验、生产试验、抗性鉴定和品质测定；负责种子工程及新品种、新技术项目的申报、组织实施和监督管理；负责农作物新品种引进、试验、示范、推广；负责主要农作物原良种生产计划、种子繁育基地建设、品种布局；管理、审核、核发农作物种子生产、经营许可证；负责申请审定主要农作物品种的审核和推荐；培训种子生产、加工、储藏技术人员、种子统计人员；负责种子专业报表和良繁报表统计。
