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（一）贯彻落实国家和自治区有关种子的法律、法规、规章和方针政策；
（二）研究提出并组织实施种子发展建设规划和年度计划；
（三）组织开展主要农作物品种审定推广前的试验以及品种真实性鉴定，组织新良种和种子新技术的试验示范及推广应用；
（四）核发、管理种子生产、经营许可证，查处违法生产、经营种子的单位和个人；
（五）负责农作物品种及种子生产、经营、质量的监督管理，组织建立健全良种繁育体系和种子质量控制体系，组织开展种子质量认证工作；
（六）负责种子行业的统计及种业信息网的建设和管理；
（七）组织落实救灾备荒种子贮备任务；
（八）负责与种子管理有关的的工作人员培训及技术交流。
（九）负责对下级种子管理机构进行指导和监督。
办公室
负责文秘、人事、职称、党务、纪检、保密、宣传、档案、广西种业信息网运行与维护、安全生产、政府采购计划与上报以及效能建设工作
计财科
负责年度经费预算、年终决算、日常财务管理以及各项经费的会计核算等工作
品种管理科
负责全区农作物新品种试验、示范体系建设，全区农作物新品种试验（鉴定），国家农作物品种试验，品种审定、登记，新品种展示、示范，试验技术及种子生产技术交流、培训以及新农村联系点建设等工作
质量管理科
负责全区种子质量控制体系建设，种子质量监督管理，种子质量纠纷处理，检验、贮藏、加工技术指导和培训，种子质量认证以及自治区农作物种子质量监督检验站的日常运行管理等工作
市场管理科
负责农作物种子生产经营许可证核发，种子市场监管，种子违法案件查处，新品种维权，救灾备荒种子储备，进出口种子审核以及种子法律法规宣传等工作
行业管理科
负责全区种业发展规划和年度计划的拟订，全区种子行业报表统计，种业信息收集发布，全区种子行业发展宏观指导，种子项目、科技项目的组织申报和实施等工作
广西国家级品种区域试验站
负责广西国家级品种区域试验站的管理运行，主要承担桂南生态区品种区域试验以及农作物新品种示范展示等工作
综合管理科
负责离退休人员管理、劳资、工青妇、计生、医保、物业、房改、日常办公用品采购以及党工青妇文体活动等后勤管理工作
