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（一）贯彻执行国家、省有关药品、医疗器械、保健食品、化妆品的法律、法规、规章和政策并组织实施。
（二）依法负责对保健食品生产、经营监管及保健食品广告的监测；依法负责对化妆品的监管。
（三）负责中药、民族药监管工作，协助实施中药品种保护制度；参与初审新药、仿制药品、中药品种保护、新药临床试验的现场核查工作；负责医院制剂注册申请的受理、初审和现场核查。
（四）配合有关部门实施国家基本药物制度，参与推荐国家基本药物目录、非处方药物目录，组织实施和监督药品分类管理制度；依法监管毒性药品、麻醉药品、精神药品、放射性药品和药品类易制毒化学品；监督实施药品（中药材）生产、医疗机构制剂质量管理规范，参与管理药品生产企业、医疗机构制剂许可证。
（五）监督实施药品经营质量管理规范，实行药品经营企业资格认定制度，参与管理药品经营企业许可证；负责中药材市场监管工作；参与医疗卫生体制改革和药品集中招标采购的相关工作；负责药品违法广告的监测。
（六）监督医疗器械的研制、生产、经营和使用；监督企业执行医疗器械注册产品标准；负责医疗器械生产、经营企业的日常监督管理；组织开展医疗器械不良事件监测和再评价工作；负责医疗器械违法广告的监测。
（七）依法查处药品、医疗器械、保健食品的研制、生产、流通、使用方面的违法行为；依法负责化妆品有关环节违法行为的查处。
（八）负责实施药品、医疗器械、保健食品、化妆品不良反应监测工作。
（九）负责全市系统财务、审计等相关工作，负责国有资产管理和政府采购工作。
（十）负责全市食品药品监督管理系统机构编制、人事管理等工作；实施执业药师资格制度；组织开展药学专业、医药工程专业初级技术职务任职资格的评定工作；负责离退休千部职工管理工作。
（十一）承办省食品药品监督管理局和南平市委、市政府交办的其他事项。
